Фундаментальный анализ является базисом анализа обращающихся на рынке капитала ценных бумаг. Он позволяет прогнозировать объем ВВП, объем продаж в различных отраслях и компаниях, уровень доходов в них. Прогнозы служат оценкой доходности, которая ожидается от тех или иных акций, некоторых отраслей и в целом фондового рынка. В ряде случае очевидность этой взаимосвязи ясна. Так, для оценки ожидаемой через год цены акции компании нужно показатель доходов компании в расчете на 1 акцию умножить на показатель прогнозного соотношения цена/доход. Такой расчет позволяет сделать прогноз ожидаемой доходности. В некоторых случаях прогноз и оценка взаимосвязаны косвенно. Так, акции, доходность которых прогнозируется выше, чем оценивают другие инвесторы, могут войти в список одобренных акций.

Ряд инвестиционных организаций, работающих с финансовыми аналитиками, используют метод прогнозирования, называемый «сверху вниз» (top-down forecasting approach). Данный метод предусматривает прогнозирование аналитиками сначала в целом всей экономики, потом отдельных ее отраслей, и в последнюю очередь тех или иных компаний. В основе прогнозов для различных отраслей лежат прогнозы общие для экономики, а в основе прогнозов для отдельных компаний лежат уже и тот и другой прогнозы.  

Среди инвестиционных организаций есть и те, которые сначала делают оценку перспектив конкретных компаний, затем прогнозируют перспективы для конкретных отраслей, а на последнем этапе делают прогноз в целом для экономики. Этот метод прогнозирования носит название «снизу вверх» (bottom-up forecasting). При использовании данного метода возможно неумышленное использование некорректных допущений. Так, оценивая объем зарубежных продаж компании Икс, аналитик применяет один прогноз курсов валют, а второй аналитик, оценивая зарубежные продажи компании Игрек, берет иную оценку тех же самых курсов валют. При использовании метода «сверху вниз» меньше возникает подобных опасностей, поскольку все аналитики компании будут исходить из одного прогноза курсов валют.

В практической деятельности нередко два эти подхода сочетаются. Так, развитие экономики в целом прогнозируется методом «сверху вниз». Полученные прогнозы финансовые аналитики используют как отправную точку для прогнозирования конкретных компаний с использованием метода «снизу вверх». Между индивидуальными прогнозами в совокупности и общим экономическим прогнозом, используемым в качестве исходного, должно быть соответствие, иначе процесс прогнозирования необходимо будет повторить, иногда с дополнительными контрольными процедурами, чтобы достичь необходимого соответствия.

Выделяют также еще один вид прогнозирования – вероятностное (probabilistic forecasting). В этом случае чаще всего основное внимание сосредотачивается на общих экономических прогнозах, так как существующая на данном уровне неопределенность представляет особую важность при определении риска, а также ожидаемой доходности портфеля, который хорошо диверсифицирован. Может быть составлено несколько прогнозных сценариев, по которым будет развиваться экономика, при этом учитывается вероятность осуществления данных сценариев. Используя возможные варианты экономического развития, прогнозируют перспективы отдельных отраслей экономики, компаний, а также динамики изменения курсов акций. Благодаря такой процедуре аналитик получает представление о том, как могут отреагировать те или иные акции на неожиданности в экономике. Такой анализ еще называют «что, если». Также оценивается вероятность осуществления различных сценариев, чтобы можно было оценить возможные риски.

Еще один инструмент прогнозирования – эконометрические модели (econometric model). Они представляют собой статистические модели, позволяющие сделать прогноз значений некоторых переменных, которые называются эндогенными переменными (endogenous variables). Для такого прогнозирования исходными данными служат значения переменных, которые носят название экзогенные переменные (exogenous variables). Значение этих переменных предполагается пользователем конкретной модели. Так, в эконометрической модели может быть сделана привязка уровня продаж автомобилей будущего года к уровню ВВП и ставок процента. Для прогнозирования объема продаж машин в будущем году (эндогенная переменная) необходимо иметь данные о ВВП и ставках процента будущего года (экзогенные переменные).

Эконометрическая модель может быть и системой большой сложности, и простейшей формулой, для подсчета которой можно использовать обычный калькулятор. Однако, так или иначе, для построения эконометрических моделей необходимо иметь экономические и статистические знания. Соответствующие взаимосвязи определяются на основе знаний экономики, а количественная природа данных взаимосвязей оценивается статистическими методами, после обработки данных за прошедший период.

Некоторые из инвестиционных организаций применяют эконометрические модели широкого масштаба, прогнозируя уровень ВВП, безработицы и инфляции в будущем, взяв за основу прогнозы федерального бюджета, инвестиций, которые планируется сделать в деловую среду, потребительских расходов. Ряд фирм и организаций некоммерческого типа специализируются на подобных моделях, предлагая различным заинтересованным компаниям и агентствам приобрести у них прогнозы и программные продукты.

Разрабатывая подобные широкомасштабные модели, специалисты предусматривают, как правило, целый ряд «стандартных» прогнозов, в основе которых лежит несколько экзогенных переменных. Ряд моделей имеют вероятность осуществления различных прогнозов. В некоторых разработках пользователям предоставлена возможность самостоятельного включения их собственных предположений и анализа прогнозов на основе данных предположений. Модели подобного рода включают множество уравнений, описывающих большое количество взаимосвязей, представляющих большую важность. Хотя в основе оценок этих взаимосвязей лежит информация за прошедший период, данные оценки определяют, сможет ли быть работа модели в будущем быть эффективной. В случае неудачных прогнозов говорят о структурных изменениях, произошедших с экономической взаимосвязью, которая положена в основу данной модели. Но неудачный прогноз может быть результатом того, что в модели были учтены не все факторы. Обе причины являются сигналом к тому, что необходимо изменить либо оценочные величины, либо концепцию модели, либо оба элемента. Большинство пользователей, по мере того как накапливают опыт, периодически перестраивают используемую эконометрическую модель.

Для многих аналитиков эффективным методом прогнозирования является изучение финансовых отчетов. Они анализирую отчеты, чтобы спрогнозировать будущее компании. Финансовый отчет является отражением результата деятельности компании, т.е. представляет собой некую модель данной компании, а создателями этой модели являются руководители и бухгалтера компании. Косвенное отношение к созданию модели имеют и налоговые органы. В разных компаниях применяются разные модели, значит, одно и то же событие рассматривается компаниями по-своему. Такое явление можно объяснить в числе прочего определенной свободой в некоторых вопросах учета, которая допускается Общепринятыми принципами бухгалтерского учета (GAAP), принятыми Советом по стандартам финансового учета (Financial Accounting Standards Board, FASB). В качестве примера можно привести амортизацию активов равномерным либо ускоренным методом, а также учет товарно-материальных запасов методами LIFO или FIFO.

Для понимания реального положения дел в той или иной компании и сравнения с ситуациями, складывающимися в иных компаниях, где используются другие методы учета, финансовому аналитику подобно детективу приходится заниматься целыми финансовыми расследованиями, отыскивая факты в сопроводительных записках и сносках финансовых отчетов. Они не принимают за истину данные отчета, пока досконально не изучат всю бухгалтерскую «кухню».

Фундаментальный анализ в конечном итоге направлен на определение величины требований финансового рода на текущий момент относительно дохода компании, в том числе и требований со стороны держателей акций и облигаций компании. Для достижения этой цели в первую очередь нужно сделать прогноз дохода компании и вероятного распределения ее дохода между кредиторами, оценивая при этом соответствующие вероятности.

В практической деятельности чаще используются менее сложные методы. Большая часть аналитиков максимум внимания уделяют цифрам, которые содержатся в отчетах компании, несмотря на то, что эти цифры не всегда служат адекватным отражением реальных экономических процессов. Сложные взаимосвязи часто оцениваются с использованием простых показателей. Так, ряд аналитиков дают оценку вероятности погашения в полном объеме или частично задолженности перед кредиторами, используя соотношение двух величин – ликвидных активов и размера краткосрочного долга. Или оценку вероятности выплаты в срок процентов держателям ценных бумаг производят с использованием соотношения таких показателей, как доход компании до выплаты процентов и размер процентов, выплачиваемых периодически. Часто обыкновенные акции оценивают путем установления соотношения между доходами компании после уплаты налогов и величиной балансовой стоимости находящихся в обращении акций данной компании.