Фундаментальный анализ используется как исследовательский инструмент для изучения финансового и экономического состояния той или иной компании. Применение фундаментального анализа позволяет достичь определенных целей, в первую очередь, отобрать эмитентов, чьи акции в перспективе способны принести максимальную прибыль. Также с его помощью проводится определение справедливой стоимости акции, называемой также внутренней стоимостью. При проведении фундаментального анализа углубленно изучаются данные о состоянии компании на текущий момент и о перспективах развития, бухгалтерские отчеты, в которых зафиксированы прибыли и убытки компании, информация, публикуемая компанией о себе. Проводится учет некоторых показателей макроэкономики, в частности процентная ставка Центробанка, уровень инфляции, уровень деловой активности. Осуществляя фундаментальный анализ, аналитик не принимает во внимание котировки акций на рынке, абстрагируясь от них. Фундаментальный анализ является отличным дополнением теханализу, который основывается на исследовании динамики цены рынка и объема торгов. При сочетании данных методов аналитик получает наиболее полное представление о ситуации на рынке и может сделать максимально точный прогноз направления движения цен акций.

Фундаментальный анализ располагает множеством различных методов, с помощью которых определяется инвестиционная привлекательность, как компаний-эмитентов, так и целых отраслей экономики. Все методы делятся на две группы в зависимости от функционального назначения. В первую входят методы, с помощью которых отбираются акции компаний с устойчивыми показателями финансово-экономического характера и высоким потенциалом развития в перспективе. Данные методы применяются, чтобы решить, включать ли ту или иную акцию в портфель инвестиций. Ко второй группе методов относятся те, с помощью которых определяется справедливая стоимость ценной бумаги. Так же с их помощью сравниваются похожие компании, относящиеся к одной отрасли, чтобы найти акции недооцененные и переоцененные.

К числу решаемых участниками фондового рынка наиболее важных задач относится необходимость разделить всех эмитентов на две отличающиеся группы, в первую из которых войдут фундаментально сильные компании, а во вторую – фундаментально слабые. Фундаментальный анализ в его классическом варианте не дает подсказок, каким образом можно произвести такое разделение. Каждый из инвесторов сам определяет критерии, которые считает самыми важными исходя из своих предпочтений в инвестировании. Однако есть общие принципы, которых придерживается большинство инвесторов.

Прежде всего, необходимо узнать все о деятельности компании, за счет чего формируется ее основной доход. Хорошо, когда инвестор разбирается во всех присутствующих на фондовом рынке отраслях, но этим могут похвастаться далеко не все. Лучшим вариантом для инвестора будет, если он сосредоточит свою инвестиционную деятельность на работе с акциями того вида бизнеса, который для него понятнее всех прочих. Уоррен Баффет, знаменитейший инвестор, считает, что финансовый успех, достигаемый на фондовом рынке, находится в прямой зависимости от понимания того, какие принципы работают внутри компании. Баффет рекомендует инвестировать в сфере собственной компетенции, при этом не важно, насколько широка данная сфера, а важна точность определения конкретных параметров. Таким образом, первым критерием для инвестора должна быть понятность для него того или иного бизнеса. Данный критерий является самым субъективным, однако ему принадлежит главная роль при выборе эмитентов.
Когда у инвестора нет глубоких знаний в той сфере, где работает изучаемая им компания, лучше взяться за другую компанию, бизнес которой боле понятен, иначе у него будет очень мало шансов получить прибыль в тех областях деятельности, которые ему малознакомы. Не помогут и различные подсказки в публикуемых аналитических обзорах. Даже если инвестор на основании безошибочного обзора приобретет акции по выгодной цене, в будущем он столкнется с риском убытков, так как не незнание сферы деятельности компании не позволит ему правильно реагировать на происходящие изменения.

Для определения справедливой цены акций наиболее часто используются два метода. Первый из них осуществляется путем сравнения компании с аналогичными. Второй называется методом дисконтированных денежных потоков (DCF). Например, к основным показателям, по которым определяется стоимость компании нефтяной отрасли, относятся объем нефтедобычи и объем запасов сырья. При делении показателя рыночной капитализации на показатель запасов определяется, сколько в среднем стоит баррель нефти в месторождении данной компании. Подобным образом производится расчет коэффициента, который отражает стоимость каждого барреля, добытого их данного месторождения. Становится очевидным, что максимальный потенциал роста при равенстве прочих условий принадлежит компаниям, чьи добыча и запасы имеют более низкую оценку. Когда акции оценены ниже, не исключено, что они недооценены рынком и в дальнейшем могут быстро вырасти.

Полученные путем таких расчетов коэффициенты используются также, чтобы сравнить стоимость компании России с их аналогами за рубежом. Так, компания из Китая CNPC намерена приобрести компанию из Казахстана PetroKazakhstan за 4,18 миллиарда долларов. Оценка запасов казахской компании – 4 доллара за баррель. Себестоимость нефтедобычи в Казахстане меньше, чем у российских компаний. Судя по показателям, компании российской нефтяной отрасли недооценены.

При помощи метода дисконтированных денежных потоков рассчитывается стоимость компании на основе ее прибыли в перспективе. В начале, основываясь на экспертных оценках, производится определение денежного потока, который генерирует компания, затем производится его сокращение, иначе дисконтирование, на величину безрисковой ставки. Метод направлен на оценку прибыли, получение которой будет происходить в течение выбранного для рассмотрения периода. Безрисоковая ставка – размещение денежных средств в инструментах наибольшей надежности. Российские бумаги чаще всего оцениваются с использованием такого показателя, как доходность облигаций Евро-30. Привлекательность акций определяется тем, превышает ли прибыль компании доход, получаемый от размещения денег в российских еврооблигациях.

Существует мнение, что фундаментальный анализ необходимо знать только тем инвесторам, которые занимаются долгосрочным инвестированием. В пользу этого мнения приводятся утверждения о том, что цена акции в краткосрочном периоде зависит лишь от количественного соотношения акций, которые выставлены на продажу и покупку, а фундаментальные характеристики компании проявляют свое влияние только на длительных временных отрезках, не менее года. Данное утверждение не бесспорно. Действительно, в краткосрочном периоде на цену акции сильно влияют факторы технического рода, которые и являются наиболее важными для краткосрочных спекулянтов. Однако следует помнить о том, что котировки на рынке часто растут или падают из-за выхода какой-либо новости большой важности. Новости содержат некую закономерность, когда о компаниях, фундаментально сильных, сообщаются хорошие данные, например, о подписании крупных контрактов, о начале новых проектов, об учреждении дочерних структур, создании совместных предприятий и т.п. Новости же о копаниях, фундаментально слабых, содержат негативную информацию о том, что, например, ожидается снижение прибыли, или ухудшается их финансовое положение и т.д. если трейдер в курсе такой закономерности, он получает возможность реализовать свое превосходство в статистическом плане путем избегания покупки акций, имеющих слабые показатели, и отказа от открытия коротких позиций, направленных против компаний, являющихся фундаментально сильными.